《温疫论》是中医温病学发展史上具有划时代意义的著作，是中医学原创思维与原创成果的杰出体现。2卷，明·吴有性（字又可）撰于崇祯十五年壬午（1642年）。此书大致为随笔劄录而成，不甚诠次，其原创思维主要体现在两个方面：
其一，创立“戾气”病因学说。吴氏强调温疫与伤寒完全不同。他明确指出：“夫温疫之为病，非风、非寒、非暑、非湿，乃天地间别有一种异气所感。”这种异气，吴氏为之命名为“戾气”。戾气侵入人体的途径是自口鼻而入。传播的方式有两种：有天受——通过自然环境而感染，有传染——通过接触患者而感染。此二者只是传播方式的不同，只要感染的是同一种戾气，那么“所感虽殊，其病则一”。戾气具有多样——为病各种、特适——某气专入某脏腑经络专发为某病、偏中——其气各异，所伤不同等特点，同时还具有传染与流行的特点。吴氏认为，“气者，物之变也”，因此，他设想最为理想的治疗是特效治疗，“能知以物制气，一病只有一药之到病已，不烦君臣佐使、品味加减之劳。”在当时的条件下，吴氏也是苦于“此气无象可见，况石声无臭”，“其来无时，其着无方”，“何能得睹得闻？人恶得而知是气？”但他的这种设想是具有超前意识的科学设想。